蛋白条:研究犬的痛苦:当你本可以发表顶级报告时,为什么你最终投资了《水杂志》?

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  阅读文献,找到一个好的话题

  我经常认为,想出一个好的研究课题比做实验更难。在我当医生的第一年,我希望通过查阅文献,能够独立地提出一个创新和可行的研究课题。从那一刻起,我真正理解了科学研究的真正核心,那就是创新思维的重要性。正如一句老话所说,如果有一天你脑海中突然冒出一种感觉,你可以发送CNS,甚至获得诺贝尔奖的想法,请不要怀疑。这意味着你没有读足够的文学作品。

  无数次想出实验课题,然后查阅相关文献又再次否定自己。其实这一过程也是锻炼自己的最佳时机,能够自己纠正自己何尝不是一次进步呢?

  确定实验方案

  在正式开始实验前,最好一开始就把实验方案确定好,我的习惯是按照最后写文章的要求来。需要纯化哪些蛋白?做哪些动物实验?数据该如何分析?等等这些其实一开始就应该计划好,以免在实验过程中出现什么问题。

  在这里,也给大家分享一个自己曾经的教训。当时,一个课题因为时间的关系,需要赶紧做,越早做完越能发个好文章。于是在一开始我们就火急火燎地确定好了要做哪些动物实验,一口气买了100多只小鼠,前后花了两个月时间,拿到了第一批的数据。可是做完实验后才发现,我们的实验设计并不完整,其中一些数据涉及到各种原因也并不能直接放在文章里。没办法,经过商议就只能重新完善实验方案,重新买小鼠做实验。这样一折腾就又两个月时间过去了。

  最后,该项课题也大大落后于预计的时间完成,原本一篇信心满满以为可以投CNS的文章,因为最后完成的时间晚了就只能投一篇比较水的子刊。

  所以,在这里想告诉大家的是,只有一开始就明确自己要做什么后,才能如期顺利的做完实验。而如果实验做到一半中途更改,发现实验数据不完整不具有逻辑性,那又只能重新设计实验。浪费试剂不说,耽误的时间将是无论如何也补不回来的!

  漫长的实验过程

  我上一个实验,从2020年7月确定选题,到2021年8月拿到最后一批数据,做了整整一年的时间。这一年来,我最大的体会还是应了那一句老话:工欲善其事,必先利其器。在实验的过程中,选则可靠的试剂耗材将会使你事半功倍。

  以核酸提取实验为例,核酸提取是各种分子生物学实验中所必需的一个技术,然而核酸的提取通常需要繁琐的步骤。在日常的实验过程中,影响核酸提取的因素其实有很多。其中,得率低可能因素就有:1、样品裂解或匀浆处理不彻底;2、RNA沉淀没有完全溶解,吸取水相时混有有机相;3、RNA沉淀未完全溶解等等。

  RNA降解原因也包括:1、组织取出后没有马上冷冻;2、细胞在胰蛋白酶里处理时间太长;3、试剂和所用器械,离心管没有经过DEPC处理,造成RNA降解。

  要记住,RNA不像DNA那样坚不可破。RNA其实很脆弱,一言不合就降解。因此,后来实验室购买了一台KingFisherApex自动磁珠纯化仪,通过自动提取核酸不仅节省了工作时间和强度,也能保证提取的RNA得率高,减少RNA污染。

  再比如常规WB操作中,从制胶到显色完至少需要一天的时间,其中制胶、跑电泳就要半天,还很麻烦。然而我是一个懒人,我认为花大量时间用在制胶跑胶这些步骤实在是对时间的一种浪费。因此,我成了实验室第一个购买使用NuPAGEBis-Tris预制胶的人。这款预制胶可以不费力气去配梯度,减少因过多操作而引起的实验失误率,且条带笔直锐利,不拖尾,尤其对分子量相差不明显的蛋白条带可实现高效分离,最快可半小时搞定电泳。

  以上说了这么多,之所以要跟大家强调选择好的实验试剂耗材,是因为使用的试剂耗材可靠性其实是直接决定了你的实验成功与否。选择一款可靠的试剂可以让你的实验事半功倍,但是如果要让你的实验可重复性好,将来师弟师妹们也能继续使用你的这一套系统的话,那么一直使用同样的耗材就显得十分重要了。

  以质粒构建实验为例,在我们实验室都习惯使用赛默飞公司的产品,诸如限制性内切酶、DNA聚合酶以及T4连接酶等都是清一色赛默飞产品,这样也避免了不同公司产品交叉使用所带来的不可预知的实验麻烦。如果随意更改使用的试剂,那么就极易可能导致实验结果重复不出来,数据与之前的研究数据也难对应得上。

  如何查资料?

  在做实验时,经常会遇到各种实验难题无法解决,尤其是对于刚进实验室的新手而言,当面临第一次做某个实验或者操作某台仪器时,往往显得无从下手。想通过查找文献获取解决方法,可是文献里对于具体的实验操作方法往往写的很含糊,更别提有什么注意要点了。

  因此,在这里给大家推荐一个实验学习的干货网址——赛默飞Invitrogen能量加油站。这个平台里积累了大量教育资源文库,其中包括应用说明、手册和资料书籍、教学视频、行业热点资讯等,对大家在日常实验中遇到的各种困难都能起到有效的帮助。

  以上这些,就是我个人做科研的一点经验之谈。祝各位读者在科研的道路上一路顺风。

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